More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1433 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1412  extracellular solute-binding protein  64.2 
 
 		 619 aa  847    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902569 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1037  ABC peptide transporter, periplasmic solute-binding protein  95.08 
 
 		 610 aa  1213    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.490346  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1433  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 610 aa  1263    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.569191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  43.37 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 		 611 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  41.17 
 
 		 615 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  37.73 
 
 		 600 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.92 
 
 		 611 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 		 633 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  41.09 
 
 		 611 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  40.9 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 		 609 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.55 
 
 		 618 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 618 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  40.28 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  40.52 
 
 		 615 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.8 
 
 		 628 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  38.02 
 
 		 602 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  38.41 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  39.72 
 
 		 670 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  38.72 
 
 		 613 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 		 622 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 611 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 		 606 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  37.92 
 
 		 626 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  39.15 
 
 		 620 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.62 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.59 
 
 		 609 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 		 609 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  37.32 
 
 		 615 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  38.29 
 
 		 633 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 		 621 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.44 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.34 
 
 		 615 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 623 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2050  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 620 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.45 
 
 		 616 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  37.28 
 
 		 601 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 609 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  38.61 
 
 		 628 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 		 627 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.88 
 
 		 614 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 		 597 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 		 621 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  37.11 
 
 		 630 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  36.91 
 
 		 626 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  35.11 
 
 		 600 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2625  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 		 610 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15211  decreased coverage  0.0000486729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 640 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  35.9 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.32 
 
 		 625 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  35.55 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 		 638 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  37.24 
 
 		 626 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  36.35 
 
 		 627 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  37.91 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 592 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 646 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  38.12 
 
 		 617 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 590 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  34.11 
 
 		 601 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2613  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674629  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 619 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  35.98 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 		 635 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  39.06 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  37.18 
 
 		 631 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 		 643 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  35.55 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 		 606 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  36.71 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  35.49 
 
 		 609 aa  364  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  36.33 
 
 		 610 aa  364  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.68 
 
 		 614 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 631 aa  362  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  35.29 
 
 		 625 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 		 602 aa  362  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  34.99 
 
 		 602 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 641 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  34.99 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 661 aa  359  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  34.83 
 
 		 602 aa  359  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  36.9 
 
 		 658 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 		 659 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 		 606 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 627 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  36.01 
 
 		 626 aa  356  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 615 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 		 622 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 		 622 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 		 624 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 636 aa  353  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  37.48 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  37.17 
 
 		 637 aa  351  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  34.09 
 
 		 638 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1807  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 665 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625712  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  34.9 
 
 		 624 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>