More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3358 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  68.6 
 
 		 630 aa  845    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  52.93 
 
 		 625 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 		 615 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  55.4 
 
 		 627 aa  695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 636 aa  1308    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  54.1 
 
 		 614 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  51.37 
 
 		 625 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  56.79 
 
 		 626 aa  695    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  53.17 
 
 		 624 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  53.3 
 
 		 621 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  52.05 
 
 		 628 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  53.34 
 
 		 624 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  50.73 
 
 		 621 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  52.3 
 
 		 626 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  53.65 
 
 		 632 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  48.73 
 
 		 626 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  50.09 
 
 		 629 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 		 633 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  43.82 
 
 		 604 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0009  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.59 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0014  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.498204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  42.46 
 
 		 600 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  42.96 
 
 		 670 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4083  twin-arginine translocation pathway signal  46.35 
 
 		 626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  40.69 
 
 		 603 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 		 613 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  42.13 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 		 615 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  41.4 
 
 		 611 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 		 615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  41.08 
 
 		 611 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.21 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  39.44 
 
 		 615 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.73 
 
 		 618 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 		 618 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  38.31 
 
 		 609 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  39.44 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  39.09 
 
 		 609 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 		 606 aa  432  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  40.78 
 
 		 643 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  39.03 
 
 		 609 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  40.58 
 
 		 633 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  40.14 
 
 		 609 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 		 641 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  38.69 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  39.09 
 
 		 646 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.62 
 
 		 609 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  40.69 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 		 590 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 610 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 		 616 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1807  extracellular solute-binding protein  39.15 
 
 		 665 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625712  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.15 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.21 
 
 		 622 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  39.73 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 637 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 622 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  38.74 
 
 		 637 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  38.49 
 
 		 641 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  38.53 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 659 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  39.43 
 
 		 617 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.49 
 
 		 611 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  38.05 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  38.06 
 
 		 635 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  38.5 
 
 		 631 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  38.47 
 
 		 621 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  38.66 
 
 		 626 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.46 
 
 		 614 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  38.57 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  37.48 
 
 		 617 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 		 623 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  38.32 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1545  putative extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 606 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.0971522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 622 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 638 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  38.19 
 
 		 626 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  37.91 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  37.57 
 
 		 602 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  38.23 
 
 		 627 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.14 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  36.71 
 
 		 602 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.59 
 
 		 628 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 605 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  36.85 
 
 		 600 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1412  extracellular solute-binding protein  36.87 
 
 		 619 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  38.5 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.14 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 620 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 640 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  37.93 
 
 		 658 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2050  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 620 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 661 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  37.18 
 
 		 598 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>