More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3826 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  74.52 
 
 		 606 aa  894    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 610 aa  1233    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  51.97 
 
 		 620 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  50.33 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  48.94 
 
 		 616 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  48.78 
 
 		 615 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2050  extracellular solute-binding protein  50.73 
 
 		 620 aa  596  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  49.66 
 
 		 592 aa  595  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  50.74 
 
 		 626 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  49.26 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  51.68 
 
 		 623 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  47.74 
 
 		 600 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  47.83 
 
 		 601 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  47.76 
 
 		 606 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2625  extracellular solute-binding protein  49.91 
 
 		 610 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15211  decreased coverage  0.0000486729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  51.28 
 
 		 621 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2613  extracellular solute-binding protein  48.43 
 
 		 604 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674629  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  43.72 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1699  extracellular solute-binding protein  42.67 
 
 		 611 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 609 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 		 611 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  40.86 
 
 		 611 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.53 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  42.23 
 
 		 633 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  41.6 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  42.4 
 
 		 602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 611 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 600 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 		 618 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  41.9 
 
 		 613 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  41.94 
 
 		 615 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  42.66 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  41.57 
 
 		 615 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.34 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  41.82 
 
 		 603 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1545  putative extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 606 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.0971522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1506  extracellular solute-binding protein  42.88 
 
 		 604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0138783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0931  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 		 618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  40.27 
 
 		 615 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  40.86 
 
 		 607 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2856  putative oligopeptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  43.28 
 
 		 603 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1437  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 		 603 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0112279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2310  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0736306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  41.24 
 
 		 597 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.41 
 
 		 628 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  40.78 
 
 		 670 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  40.13 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 		 638 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 606 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 		 621 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.25 
 
 		 622 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 		 622 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  37.48 
 
 		 617 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  40.21 
 
 		 641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 637 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  38.99 
 
 		 637 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  39.62 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 609 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  39.18 
 
 		 641 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  39.16 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 		 627 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 609 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  36.35 
 
 		 622 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 		 636 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  40.07 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  37.98 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.36 
 
 		 609 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  37.98 
 
 		 646 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  38.5 
 
 		 624 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1343  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 609 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  38.25 
 
 		 590 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  38.7 
 
 		 624 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  35.99 
 
 		 638 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 		 627 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 635 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  37.46 
 
 		 609 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1412  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 619 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  38.95 
 
 		 638 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.23 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.5 
 
 		 614 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 621 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  36.74 
 
 		 622 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  35.91 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.41 
 
 		 611 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  37.44 
 
 		 628 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  37.73 
 
 		 625 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  36.44 
 
 		 630 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.33 
 
 		 614 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  35.91 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  37.52 
 
 		 658 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.84 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 622 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2646  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 		 599 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>