More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2274 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  55 
 
 		 670 aa  644    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  53.6 
 
 		 603 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  53.42 
 
 		 613 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  54.32 
 
 		 609 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  62.22 
 
 		 633 aa  717    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  52.53 
 
 		 611 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  53.26 
 
 		 611 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 600 aa  1221    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  53.72 
 
 		 607 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  54.95 
 
 		 615 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  52.92 
 
 		 611 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  53.26 
 
 		 611 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  52.52 
 
 		 615 aa  621  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  51.49 
 
 		 618 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.32 
 
 		 618 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  50.84 
 
 		 611 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.92 
 
 		 628 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  49.83 
 
 		 615 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  51.49 
 
 		 613 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  50.43 
 
 		 615 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  51.28 
 
 		 641 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  47.81 
 
 		 606 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  51.02 
 
 		 637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  50.94 
 
 		 637 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.6 
 
 		 609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  47.76 
 
 		 609 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  49.83 
 
 		 641 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  49.57 
 
 		 659 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  47.24 
 
 		 609 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  49.74 
 
 		 631 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 		 646 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  49.25 
 
 		 617 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  46.99 
 
 		 609 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  47.53 
 
 		 590 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  47.42 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  47.75 
 
 		 626 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  46.86 
 
 		 622 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  46.25 
 
 		 610 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  50.26 
 
 		 621 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  46.09 
 
 		 614 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  48.34 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  48.97 
 
 		 638 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  44.39 
 
 		 622 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  47.03 
 
 		 609 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  46.76 
 
 		 616 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  46.19 
 
 		 626 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.16 
 
 		 610 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  48.64 
 
 		 638 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  48.72 
 
 		 631 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  45.36 
 
 		 640 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  46.75 
 
 		 615 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  45.62 
 
 		 602 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  46.55 
 
 		 627 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  48.34 
 
 		 619 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  46.21 
 
 		 626 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  45.11 
 
 		 632 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  48.61 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  46.94 
 
 		 631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  44.87 
 
 		 621 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  45.55 
 
 		 597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  45.68 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  47.01 
 
 		 605 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  45.08 
 
 		 625 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  44.61 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  43.84 
 
 		 625 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  44.12 
 
 		 624 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  43.72 
 
 		 626 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  44.25 
 
 		 628 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  45.1 
 
 		 610 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 622 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  44.93 
 
 		 610 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  43.37 
 
 		 611 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  44.71 
 
 		 631 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  43.91 
 
 		 630 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  44.61 
 
 		 606 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  42.57 
 
 		 621 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  40.53 
 
 		 602 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 629 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  40.77 
 
 		 602 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  41.43 
 
 		 602 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  40.77 
 
 		 602 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1480  extracellular solute-binding protein family 5  42.6 
 
 		 604 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  40.6 
 
 		 602 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  40.7 
 
 		 600 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  41.64 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  40.03 
 
 		 602 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02107  predicted oligopeptide transporter subunit  42.6 
 
 		 604 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  42.04 
 
 		 615 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0781  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  42.76 
 
 		 604 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02066  hypothetical protein  42.6 
 
 		 604 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3315  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  42.6 
 
 		 604 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.644955  normal  0.133502 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.87 
 
 		 616 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  42.46 
 
 		 636 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1545  putative extracellular solute-binding protein  44.33 
 
 		 606 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.0971522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2315  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  42.6 
 
 		 604 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2475  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  42.26 
 
 		 604 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1470  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 		 604 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000141163  normal  0.0234366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  42.26 
 
 		 604 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  43.99 
 
 		 661 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>