More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1348 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  52.48 
 
 		 611 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  52.9 
 
 		 609 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  52.62 
 
 		 615 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  52.99 
 
 		 611 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 603 aa  1241    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  53.58 
 
 		 615 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 		 611 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  52.93 
 
 		 600 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  58.9 
 
 		 607 aa  723    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  52.23 
 
 		 611 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  51.4 
 
 		 633 aa  633  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.37 
 
 		 618 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  53.16 
 
 		 613 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  53.74 
 
 		 618 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  52.12 
 
 		 615 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  51.04 
 
 		 613 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  52.46 
 
 		 615 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.94 
 
 		 628 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  51.44 
 
 		 611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 670 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  47.77 
 
 		 606 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  49.15 
 
 		 659 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  48.38 
 
 		 602 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  48.14 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  46.72 
 
 		 622 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  45.63 
 
 		 622 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  49.4 
 
 		 638 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  45.94 
 
 		 609 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  46.62 
 
 		 641 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.87 
 
 		 610 aa  538  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  46.03 
 
 		 617 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  45.44 
 
 		 626 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  48.19 
 
 		 631 aa  531  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  47.77 
 
 		 621 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  47.83 
 
 		 658 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  45.14 
 
 		 609 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  45.88 
 
 		 627 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  44.97 
 
 		 609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.68 
 
 		 609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  44.95 
 
 		 626 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  45.24 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 		 590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  45.52 
 
 		 646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  46.11 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  46.4 
 
 		 637 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  46.4 
 
 		 637 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  45.17 
 
 		 609 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  45.55 
 
 		 641 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  45.42 
 
 		 626 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  44.9 
 
 		 615 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 640 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  46.68 
 
 		 631 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  44.48 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  44.59 
 
 		 616 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  43.22 
 
 		 611 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  45.14 
 
 		 605 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  45.49 
 
 		 631 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  45.19 
 
 		 614 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  44.48 
 
 		 619 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  42.09 
 
 		 622 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  42.02 
 
 		 625 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1412  extracellular solute-binding protein  44.82 
 
 		 619 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  42.03 
 
 		 625 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  42.71 
 
 		 630 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  45.32 
 
 		 627 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  45.21 
 
 		 661 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 		 617 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  42.01 
 
 		 624 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1433  extracellular solute-binding protein  43.1 
 
 		 610 aa  473  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.569191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  42.34 
 
 		 624 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  42.18 
 
 		 614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  43.32 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  40.92 
 
 		 622 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  41.37 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  44.23 
 
 		 628 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1037  ABC peptide transporter, periplasmic solute-binding protein  43.1 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.490346  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  43.77 
 
 		 626 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  40.69 
 
 		 636 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  43.08 
 
 		 602 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  41.04 
 
 		 610 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.44 
 
 		 622 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  40.56 
 
 		 622 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  43.08 
 
 		 602 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  42.56 
 
 		 621 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  41.52 
 
 		 621 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  43.08 
 
 		 602 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  41.7 
 
 		 626 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  41.21 
 
 		 628 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  42.56 
 
 		 601 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2646  extracellular solute-binding protein  42.11 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  44.59 
 
 		 625 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  42.93 
 
 		 631 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  42.5 
 
 		 602 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  42.83 
 
 		 606 aa  458  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  41.06 
 
 		 632 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 		 643 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  43.74 
 
 		 628 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  41.93 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  40.2 
 
 		 600 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>