More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0289 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  77.31 
 
 		 621 aa  994    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  54.15 
 
 		 624 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  70.78 
 
 		 614 aa  887    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 632 aa  1294    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  54.41 
 
 		 630 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  76.56 
 
 		 625 aa  1003    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  56.56 
 
 		 615 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  51.18 
 
 		 629 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  77.5 
 
 		 621 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  57.97 
 
 		 627 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  54.33 
 
 		 626 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  77.9 
 
 		 626 aa  988    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  89.54 
 
 		 628 aa  1151    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  54.77 
 
 		 624 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  55.35 
 
 		 625 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  60.76 
 
 		 626 aa  725    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  53.65 
 
 		 636 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  45.11 
 
 		 600 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0009  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.81 
 
 		 615 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  45.74 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0014  extracellular solute-binding protein  44.17 
 
 		 615 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.498204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  43.74 
 
 		 670 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4083  twin-arginine translocation pathway signal  47.19 
 
 		 626 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  44.35 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 611 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  43.12 
 
 		 633 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  43.23 
 
 		 611 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  43.11 
 
 		 615 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.5 
 
 		 618 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 		 613 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 		 618 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  41.06 
 
 		 603 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  41.86 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  40.66 
 
 		 613 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  41.2 
 
 		 615 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  40.31 
 
 		 615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.02 
 
 		 609 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.67 
 
 		 609 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  40.83 
 
 		 590 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  39.54 
 
 		 609 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 		 646 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  40.07 
 
 		 610 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  42 
 
 		 643 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  40.64 
 
 		 626 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  41.4 
 
 		 633 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  40.3 
 
 		 609 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 597 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  41.41 
 
 		 645 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 616 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  41.58 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  40.17 
 
 		 609 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  39.75 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 641 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 609 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 631 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 635 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.58 
 
 		 614 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  39.38 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  40.91 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 		 659 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  40.1 
 
 		 617 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 638 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  39.66 
 
 		 637 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 		 637 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  39.49 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  39.33 
 
 		 641 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  38.14 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 621 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  39.76 
 
 		 658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 605 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 622 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.33 
 
 		 622 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.33 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.17 
 
 		 654 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 		 627 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38 
 
 		 625 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 622 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  37.86 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.7 
 
 		 628 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.42 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 623 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2017  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 		 604 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  37.48 
 
 		 613 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 640 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  37.73 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  36.51 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  38.29 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 		 622 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1807  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 665 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625712  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.31 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 		 643 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.31 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 		 661 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.31 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>