More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4083 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  56.31 
 
 		 604 aa  695    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0009  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  56.12 
 
 		 615 aa  708    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0014  extracellular solute-binding protein  57.19 
 
 		 615 aa  723    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.498204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4083  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 626 aa  1285    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  49.66 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  48.08 
 
 		 626 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  47.94 
 
 		 627 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  47.4 
 
 		 621 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  48.46 
 
 		 615 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  47.75 
 
 		 625 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  48.98 
 
 		 626 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  47.12 
 
 		 630 aa  538  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  47.19 
 
 		 632 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  46.34 
 
 		 628 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  45.74 
 
 		 621 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  47.87 
 
 		 624 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  47.7 
 
 		 624 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  44.55 
 
 		 625 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  45.21 
 
 		 626 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  46.35 
 
 		 636 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  46.02 
 
 		 629 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  42.44 
 
 		 633 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 610 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 609 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.5 
 
 		 609 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 609 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 643 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 616 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 590 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 615 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  41.47 
 
 		 645 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.17 
 
 		 609 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 		 615 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.63 
 
 		 609 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  41.3 
 
 		 645 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  39.4 
 
 		 611 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 646 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  39.19 
 
 		 633 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  39.73 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 600 aa  415  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  38.94 
 
 		 603 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 		 618 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3863  extracellular solute-binding protein  38.9 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.08 
 
 		 618 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  40.47 
 
 		 670 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 611 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  38.71 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  37.52 
 
 		 613 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  38.14 
 
 		 658 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 643 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  37.58 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  40.73 
 
 		 617 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  37.99 
 
 		 615 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 		 613 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 621 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  36.74 
 
 		 609 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  38.46 
 
 		 615 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  40.61 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1807  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 		 665 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625712  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2128  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 609 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 		 597 aa  379  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3814  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 650 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 659 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 		 605 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  38.09 
 
 		 661 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  36.87 
 
 		 602 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2017  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 604 aa  365  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1810  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 		 624 aa  364  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0607685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.28 
 
 		 628 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  37.66 
 
 		 631 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 		 627 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 		 641 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1918  extracellular solute-binding protein family 5  39.12 
 
 		 624 aa  362  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 622 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 606 aa  360  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 627 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  37.82 
 
 		 631 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.25 
 
 		 623 aa  359  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  38.34 
 
 		 627 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2973  extracellular solute-binding protein  37.75 
 
 		 609 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.17 
 
 		 654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 606 aa  357  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 627 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 624 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  34.18 
 
 		 616 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 624 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.32 
 
 		 614 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  38.34 
 
 		 624 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 		 631 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 601 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  38.32 
 
 		 637 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  35.97 
 
 		 613 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  35.52 
 
 		 602 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 637 aa  353  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1237  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 622 aa  352  8.999999999999999e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 		 640 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>