More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0009 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 604 aa  1256    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0009  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.83 
 
 		 615 aa  1253    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0014  extracellular solute-binding protein  81.95 
 
 		 615 aa  1062    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.498204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4083  twin-arginine translocation pathway signal  56.31 
 
 		 626 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 		 615 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  46.59 
 
 		 625 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  45.98 
 
 		 627 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  47.66 
 
 		 626 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  46.31 
 
 		 614 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  47.49 
 
 		 630 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  46.17 
 
 		 624 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  46 
 
 		 624 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  45.18 
 
 		 621 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 626 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  45.39 
 
 		 628 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  45.74 
 
 		 632 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 		 625 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  45.04 
 
 		 636 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  43.12 
 
 		 626 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  43.97 
 
 		 621 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  44.6 
 
 		 629 aa  492  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  41.04 
 
 		 600 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.71 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  41.05 
 
 		 609 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  41.34 
 
 		 670 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  39.63 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  39.7 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 616 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  40.03 
 
 		 603 aa  429  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 646 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  41.09 
 
 		 615 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 611 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 		 610 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  38.98 
 
 		 609 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.03 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  39.62 
 
 		 607 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 606 aa  419  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  39.12 
 
 		 626 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 		 609 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  38.13 
 
 		 609 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 631 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.54 
 
 		 613 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 641 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 597 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  38.2 
 
 		 621 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 613 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 		 659 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  38.85 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  38.9 
 
 		 637 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  39.43 
 
 		 658 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  38.5 
 
 		 615 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  38.27 
 
 		 633 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.34 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  38.34 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  37.86 
 
 		 617 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 		 637 aa  389  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  38.18 
 
 		 641 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.17 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.12 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 645 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  37.48 
 
 		 645 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 		 638 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 		 643 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  38.17 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  38.31 
 
 		 631 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  37.86 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 635 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2128  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 603 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.603606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  35.95 
 
 		 602 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.15 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1807  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 665 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625712  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 		 661 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  36.47 
 
 		 602 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3863  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 643 aa  364  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 605 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  37.52 
 
 		 619 aa  364  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 592 aa  363  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.3 
 
 		 615 aa  363  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 		 627 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 622 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  34.21 
 
 		 602 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.13 
 
 		 616 aa  360  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3144  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 637 aa  359  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2017  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 		 604 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 602 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 643 aa  356  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.35 
 
 		 614 aa  357  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 		 617 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 		 627 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 601 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.94 
 
 		 611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  36.61 
 
 		 604 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 627 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>