More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3863 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  55.81 
 
 		 643 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  61.41 
 
 		 633 aa  726    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  56.69 
 
 		 645 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  56.74 
 
 		 645 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3863  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 643 aa  1312    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1807  extracellular solute-binding protein  50.24 
 
 		 665 aa  601  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625712  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  45.01 
 
 		 616 aa  537  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 		 626 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 		 633 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 		 615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 627 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 609 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 		 600 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  40.33 
 
 		 626 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 615 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 616 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  39.52 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 610 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  38.38 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  39.16 
 
 		 625 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  39.04 
 
 		 630 aa  392  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  38.25 
 
 		 626 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.79 
 
 		 609 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  39.12 
 
 		 625 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.37 
 
 		 614 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  38.31 
 
 		 603 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0014  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 		 615 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.498204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  38.13 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  39.06 
 
 		 624 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  37.54 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  36.77 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 611 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 632 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 613 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 597 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  38.9 
 
 		 624 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 		 646 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 		 621 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  36.6 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  38.09 
 
 		 615 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 		 628 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  37.04 
 
 		 621 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 670 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4083  twin-arginine translocation pathway signal  39.06 
 
 		 626 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0009  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.99 
 
 		 615 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.99 
 
 		 604 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  35.9 
 
 		 626 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.59 
 
 		 618 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 		 627 aa  361  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 661 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  35.57 
 
 		 610 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  35.68 
 
 		 609 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  39.07 
 
 		 627 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 		 622 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 		 627 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 627 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  36.66 
 
 		 615 aa  350  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 601 aa  349  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.65 
 
 		 614 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.61 
 
 		 623 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  35.97 
 
 		 615 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.1 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.08 
 
 		 650 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.08 
 
 		 650 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 638 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.08 
 
 		 650 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  36.36 
 
 		 602 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.36 
 
 		 650 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.62 
 
 		 622 aa  347  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.23 
 
 		 936 aa  347  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.44 
 
 		 654 aa  347  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 		 622 aa  347  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 624 aa  346  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1037  ABC peptide transporter, periplasmic solute-binding protein  34.41 
 
 		 610 aa  346  8e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.490346  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  36.08 
 
 		 628 aa  346  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 624 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  35.28 
 
 		 610 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.27 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.47 
 
 		 686 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  36.82 
 
 		 637 aa  345  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1978  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.73 
 
 		 686 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00175999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  36.03 
 
 		 628 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.19 
 
 		 650 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  36.3 
 
 		 598 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 		 619 aa  343  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1412  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 619 aa  343  8e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902569 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.67 
 
 		 616 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  36.64 
 
 		 637 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1433  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 610 aa  342  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.569191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 624 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  36.3 
 
 		 641 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  36.3 
 
 		 643 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>