More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2062 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.99 
 
 		 936 aa  1050    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  61.15 
 
 		 625 aa  723    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 624 aa  1265    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.99 
 
 		 650 aa  1042    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  85.34 
 
 		 650 aa  1025    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  59.37 
 
 		 627 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  91.39 
 
 		 627 aa  1139    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1104  extracellular solute-binding protein family 5  58.18 
 
 		 622 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  85.52 
 
 		 686 aa  1026    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  75.42 
 
 		 613 aa  944    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  93.43 
 
 		 623 aa  1169    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1978  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  85.69 
 
 		 686 aa  1031    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00175999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  90.31 
 
 		 627 aa  1080    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1237  extracellular solute-binding protein  56.64 
 
 		 622 aa  696    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  99.2 
 
 		 624 aa  1259    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  60.69 
 
 		 628 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  53.5 
 
 		 601 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  75.79 
 
 		 654 aa  961    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.99 
 
 		 650 aa  1042    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.99 
 
 		 650 aa  1042    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  60.71 
 
 		 628 aa  748    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  59.32 
 
 		 661 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  99.84 
 
 		 624 aa  1264    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  85.52 
 
 		 650 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  70.87 
 
 		 640 aa  910    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  91.2 
 
 		 627 aa  1136    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2017  extracellular solute-binding protein  53.24 
 
 		 604 aa  631  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  53.6 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1448  extracellular solute-binding protein family 5  53.3 
 
 		 651 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2993  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  52.03 
 
 		 625 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1725  extracellular solute-binding protein  53.87 
 
 		 624 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0449384  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1710  extracellular solute-binding protein  53.71 
 
 		 624 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6368  extracellular solute-binding protein  53.71 
 
 		 624 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.230744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5001  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  54.61 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.95388  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2128  extracellular solute-binding protein  50.51 
 
 		 603 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1810  extracellular solute-binding protein  50.52 
 
 		 624 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0607685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  51.6 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1918  extracellular solute-binding protein family 5  50.52 
 
 		 624 aa  581  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1539  extracellular solute-binding protein  49.26 
 
 		 617 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.738539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3814  extracellular solute-binding protein  49.36 
 
 		 650 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2973  extracellular solute-binding protein  48.91 
 
 		 609 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 		 597 aa  544  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  48.55 
 
 		 658 aa  529  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1277  extracellular solute-binding protein  47.17 
 
 		 641 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  44.29 
 
 		 615 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  44.18 
 
 		 615 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  43.16 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  42.55 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  42.62 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  42.59 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  42.76 
 
 		 603 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  42.38 
 
 		 611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 		 600 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  41.86 
 
 		 613 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  42.78 
 
 		 615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  42.76 
 
 		 618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.42 
 
 		 618 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  43.41 
 
 		 602 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  41.98 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  42.96 
 
 		 670 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  39.12 
 
 		 606 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  41.55 
 
 		 615 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.17 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.2 
 
 		 628 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  39.49 
 
 		 622 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 622 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  39.12 
 
 		 622 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  39.54 
 
 		 626 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  39.22 
 
 		 609 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 		 641 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  40.92 
 
 		 637 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  41.01 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  40.92 
 
 		 637 aa  399  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  37.17 
 
 		 638 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.53 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 627 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0931  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 618 aa  399  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  39.13 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 		 616 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 627 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  40.34 
 
 		 629 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  40.98 
 
 		 617 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2856  putative oligopeptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  40.41 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  40.75 
 
 		 641 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 646 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 590 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1506  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 604 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0138783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1437  extracellular solute-binding protein  40.03 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0112279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.38 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.01 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  39.62 
 
 		 631 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 		 611 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 606 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 640 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>