More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1710 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5001  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  85.9 
 
 		 640 aa  1103    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.95388  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2993  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  76.17 
 
 		 625 aa  983    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6368  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 624 aa  1280    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.230744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1710  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 624 aa  1280    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1725  extracellular solute-binding protein  99.36 
 
 		 624 aa  1269    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0449384  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1448  extracellular solute-binding protein family 5  77.47 
 
 		 651 aa  973    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.38 
 
 		 936 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.38 
 
 		 650 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.38 
 
 		 650 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.38 
 
 		 650 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  54.14 
 
 		 627 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.54 
 
 		 686 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.36 
 
 		 650 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.54 
 
 		 650 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  53.81 
 
 		 623 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  52.48 
 
 		 654 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  52.13 
 
 		 613 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  51.06 
 
 		 640 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  53.64 
 
 		 627 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1978  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.02 
 
 		 686 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00175999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  53.87 
 
 		 624 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  54.69 
 
 		 627 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  53.71 
 
 		 624 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  54.17 
 
 		 624 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  49.57 
 
 		 625 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  48.06 
 
 		 628 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  48.1 
 
 		 628 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  47.01 
 
 		 627 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  48.33 
 
 		 661 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1237  extracellular solute-binding protein  47.05 
 
 		 622 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1539  extracellular solute-binding protein  45.42 
 
 		 617 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.738539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  43.76 
 
 		 601 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2017  extracellular solute-binding protein  44.19 
 
 		 604 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2973  extracellular solute-binding protein  44.11 
 
 		 609 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1104  extracellular solute-binding protein family 5  46.13 
 
 		 622 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1918  extracellular solute-binding protein family 5  44.8 
 
 		 624 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1810  extracellular solute-binding protein  44.63 
 
 		 624 aa  498  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0607685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  43.45 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  43.72 
 
 		 643 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2128  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 		 603 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.603606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  43.23 
 
 		 658 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  41.68 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1277  extracellular solute-binding protein  43.71 
 
 		 641 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3814  extracellular solute-binding protein  40.7 
 
 		 650 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  39.83 
 
 		 602 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 611 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  37.66 
 
 		 611 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 		 611 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  38.78 
 
 		 603 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  35.94 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 		 618 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 613 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 		 633 aa  392  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 615 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.68 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  36.85 
 
 		 615 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 615 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 606 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  36.88 
 
 		 613 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  38.44 
 
 		 670 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.46 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 622 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 		 622 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 611 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 590 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  36.13 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 		 646 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.66 
 
 		 622 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  35.93 
 
 		 638 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 		 609 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 		 626 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.91 
 
 		 609 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 622 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.61 
 
 		 610 aa  355  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 606 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 617 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  36.98 
 
 		 606 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.63 
 
 		 615 aa  350  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.63 
 
 		 616 aa  350  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 623 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.38 
 
 		 628 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 627 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  36.61 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  36.64 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 638 aa  343  8e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2646  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 		 599 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2713  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 		 608 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.89 
 
 		 611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  36.35 
 
 		 637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  35.26 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  35.51 
 
 		 609 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 		 621 aa  337  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  34.19 
 
 		 626 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  33.99 
 
 		 609 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>