More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1539 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1539  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
617 aa  1275    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.738539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  49.66 
 
 
627 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  47.65 
 
 
613 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 
627 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.4 
 
 
650 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.4 
 
 
650 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  46.92 
 
 
654 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.4 
 
 
936 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.4 
 
 
650 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  49.74 
 
 
627 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.98 
 
 
686 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  49.74 
 
 
624 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  47.62 
 
 
628 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  49.57 
 
 
624 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  49.74 
 
 
624 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1978  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.7 
 
 
686 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00175999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.22 
 
 
650 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.22 
 
 
650 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  48.18 
 
 
623 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  46.63 
 
 
628 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  46.93 
 
 
640 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 
627 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  45.97 
 
 
625 aa  538  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2993  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  45.44 
 
 
625 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17711  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  46.18 
 
 
661 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1448  extracellular solute-binding protein family 5  46.32 
 
 
651 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1237  extracellular solute-binding protein  44.8 
 
 
622 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469932  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6368  extracellular solute-binding protein  45.42 
 
 
624 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.230744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1710  extracellular solute-binding protein  45.42 
 
 
624 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1725  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 
624 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0449384  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5001  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  46.35 
 
 
640 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.95388  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1104  extracellular solute-binding protein family 5  44.98 
 
 
622 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  43.52 
 
 
601 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2017  extracellular solute-binding protein  43.19 
 
 
604 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2128  extracellular solute-binding protein  43.76 
 
 
603 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.603606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2973  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 
609 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  41.09 
 
 
643 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  41.74 
 
 
598 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1810  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 
624 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0607685  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1918  extracellular solute-binding protein family 5  41.81 
 
 
624 aa  459  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 
597 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3814  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 
650 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  41.75 
 
 
658 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 
609 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1277  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 
641 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 
633 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  37.24 
 
 
603 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 
600 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 
615 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 
615 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  37.08 
 
 
611 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  36.48 
 
 
602 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  37.25 
 
 
615 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  37.37 
 
 
615 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  36.07 
 
 
611 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.95 
 
 
609 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 
611 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  36.42 
 
 
613 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  37.34 
 
 
607 aa  369  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 
609 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 
611 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 
621 aa  364  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 
613 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.03 
 
 
618 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  37.03 
 
 
617 aa  362  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 
670 aa  355  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
622 aa  351  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 
619 aa  349  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 
606 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.29 
 
 
622 aa  345  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 
631 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.12 
 
 
610 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 
626 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  33.39 
 
 
626 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
610 aa  339  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  34.57 
 
 
616 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  34.41 
 
 
614 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 
622 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  36.09 
 
 
631 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  36.33 
 
 
631 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  33 
 
 
609 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 
635 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
609 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  33.9 
 
 
609 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
590 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 
638 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
646 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 
659 aa  335  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 
622 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  35.49 
 
 
641 aa  330  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.51 
 
 
628 aa  329  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 
641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  34.52 
 
 
614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  34.34 
 
 
626 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  35.43 
 
 
637 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.79 
 
 
622 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 
627 aa  327  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.99 
 
 
611 aa  327  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
605 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>