More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3741 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3078  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  60.26 
 
 		 642 aa  750    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  74.35 
 
 		 638 aa  970    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  63.24 
 
 		 622 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  75.33 
 
 		 627 aa  964    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  62.09 
 
 		 622 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  64.03 
 
 		 622 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  59.93 
 
 		 617 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 623 aa  1275    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2713  extracellular solute-binding protein  60.07 
 
 		 608 aa  762    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2646  extracellular solute-binding protein  61.91 
 
 		 599 aa  772    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2788  extracellular solute-binding protein  61.03 
 
 		 640 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0852598  normal  0.110267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  49.26 
 
 		 615 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  49.91 
 
 		 615 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  50.82 
 
 		 602 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  49.5 
 
 		 611 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  48.6 
 
 		 613 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 		 611 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  49.5 
 
 		 611 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 		 611 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  48.82 
 
 		 613 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  48.99 
 
 		 615 aa  581  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  48.9 
 
 		 618 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.74 
 
 		 618 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  40.7 
 
 		 607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  40.97 
 
 		 600 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 		 633 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.04 
 
 		 609 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 609 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 		 609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  42.09 
 
 		 609 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 		 616 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 615 aa  445  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  42.09 
 
 		 646 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  39.9 
 
 		 603 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 		 610 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 		 590 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  40.03 
 
 		 626 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  41.38 
 
 		 609 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  39.45 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.49 
 
 		 628 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  39.1 
 
 		 658 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 		 606 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  39.43 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  39.43 
 
 		 602 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  39.27 
 
 		 602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  38.37 
 
 		 602 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  38.37 
 
 		 602 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  38.45 
 
 		 661 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  39.66 
 
 		 625 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.9 
 
 		 936 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 606 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.9 
 
 		 650 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.9 
 
 		 650 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  38.2 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  38.89 
 
 		 628 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.9 
 
 		 650 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 627 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 		 611 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  37.76 
 
 		 625 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 		 629 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  38.32 
 
 		 626 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.98 
 
 		 611 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.21 
 
 		 650 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.21 
 
 		 686 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 638 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 670 aa  389  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  37.79 
 
 		 628 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.94 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 624 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  38.22 
 
 		 624 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 592 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 627 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.03 
 
 		 650 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 627 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1978  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.29 
 
 		 686 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00175999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 621 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  38.95 
 
 		 627 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  37.32 
 
 		 615 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  38.95 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  38.95 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.07 
 
 		 616 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 624 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  37.33 
 
 		 606 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  34.31 
 
 		 600 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  35.39 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 640 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02066  hypothetical protein  36.47 
 
 		 604 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.07 
 
 		 615 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2432  extracellular solute-binding protein family 5  36.07 
 
 		 603 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  36.3 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.61 
 
 		 623 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 640 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 628 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 641 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>