More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2432 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02107  predicted oligopeptide transporter subunit  62.69 
 
 		 604 aa  807    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1480  extracellular solute-binding protein family 5  62.52 
 
 		 604 aa  805    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2365  extracellular solute-binding protein  62.19 
 
 		 601 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0436387  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2456  extracellular solute-binding protein  62.19 
 
 		 601 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  62.88 
 
 		 600 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3315  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  63.02 
 
 		 604 aa  806    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.644955  normal  0.133502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2453  extracellular solute-binding protein  62.19 
 
 		 601 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000003014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  62.85 
 
 		 604 aa  806    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  62.88 
 
 		 602 aa  822    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2410  extracellular solute-binding protein  62.19 
 
 		 601 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1470  extracellular solute-binding protein  62.69 
 
 		 604 aa  807    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000141163  normal  0.0234366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2336  extracellular solute-binding protein family 5  77.11 
 
 		 603 aa  966    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  67.33 
 
 		 602 aa  865    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  71.64 
 
 		 602 aa  923    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2315  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  62.52 
 
 		 604 aa  805    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2567  extracellular solute-binding protein  62.02 
 
 		 601 aa  802    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2432  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 603 aa  1238    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02066  hypothetical protein  62.69 
 
 		 604 aa  807    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  71.33 
 
 		 602 aa  917    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2475  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  62.85 
 
 		 604 aa  806    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  67.33 
 
 		 602 aa  864    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  67.16 
 
 		 602 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0781  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  62.85 
 
 		 604 aa  804    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  50.42 
 
 		 611 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  41.19 
 
 		 633 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  41.74 
 
 		 600 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  43.54 
 
 		 615 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  42.14 
 
 		 607 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.86 
 
 		 628 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  41.74 
 
 		 613 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  42.11 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  42.11 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 611 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 		 611 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 613 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 		 615 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 		 611 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  42.41 
 
 		 603 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  40.77 
 
 		 609 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  41.61 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  42.02 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.21 
 
 		 618 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 618 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  40.8 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 		 606 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  37.52 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.89 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 610 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  37.52 
 
 		 646 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  37.21 
 
 		 590 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  36.39 
 
 		 626 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 622 aa  399  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  36.63 
 
 		 609 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  36.88 
 
 		 609 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 670 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  38.34 
 
 		 638 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.5 
 
 		 622 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  37.96 
 
 		 617 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.27 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 622 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  38.5 
 
 		 625 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  38.13 
 
 		 638 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 		 629 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  38.19 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 622 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  37.09 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 622 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 		 659 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  36.38 
 
 		 641 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2646  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  36.48 
 
 		 638 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.36 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 		 631 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 623 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 635 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 621 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 		 626 aa  365  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 		 627 aa  365  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2713  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 		 608 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 615 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 		 627 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.2 
 
 		 614 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  36.35 
 
 		 631 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3144  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 		 637 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  36.02 
 
 		 626 aa  360  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  36.67 
 
 		 626 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.9 
 
 		 614 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  36.88 
 
 		 624 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 624 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  35.4 
 
 		 601 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2788  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 640 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0852598  normal  0.110267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 636 aa  354  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 640 aa  354  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 637 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  36.24 
 
 		 637 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>