More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2326 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02107  predicted oligopeptide transporter subunit  99.17 
 
 		 604 aa  1234    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1480  extracellular solute-binding protein family 5  98.51 
 
 		 604 aa  1228    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173724  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  53.34 
 
 		 611 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  63.46 
 
 		 602 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02066  hypothetical protein  99.17 
 
 		 604 aa  1234    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  67.28 
 
 		 602 aa  865    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2365  extracellular solute-binding protein  87.02 
 
 		 601 aa  1114    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0436387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  66.45 
 
 		 602 aa  857    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  67.44 
 
 		 602 aa  867    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2432  extracellular solute-binding protein family 5  62.85 
 
 		 603 aa  806    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  62.62 
 
 		 602 aa  805    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2453  extracellular solute-binding protein  87.19 
 
 		 601 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000003014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  67.28 
 
 		 602 aa  865    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2456  extracellular solute-binding protein  87.19 
 
 		 601 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1470  extracellular solute-binding protein  99.17 
 
 		 604 aa  1234    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000141163  normal  0.0234366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2315  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  98.68 
 
 		 604 aa  1230    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2475  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  99.17 
 
 		 604 aa  1232    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0781  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  98.84 
 
 		 604 aa  1231    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2410  extracellular solute-binding protein  87.19 
 
 		 601 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3315  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  99.01 
 
 		 604 aa  1232    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.644955  normal  0.133502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2336  extracellular solute-binding protein family 5  63.17 
 
 		 603 aa  793    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 604 aa  1242    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2567  extracellular solute-binding protein  87.19 
 
 		 601 aa  1116    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  79.03 
 
 		 600 aa  1015    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 		 633 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 		 600 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  42.27 
 
 		 613 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  40.83 
 
 		 607 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  43.06 
 
 		 615 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  41.57 
 
 		 615 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 		 611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  42.05 
 
 		 611 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.93 
 
 		 628 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  41.15 
 
 		 615 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  41.81 
 
 		 606 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  41.22 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.83 
 
 		 609 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.48 
 
 		 618 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  40.9 
 
 		 618 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  40.03 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  40.66 
 
 		 609 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  40.27 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 		 611 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 		 609 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  38.16 
 
 		 626 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  39.84 
 
 		 602 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 		 616 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 670 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.73 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  38.78 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  37.98 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 		 590 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  37.98 
 
 		 646 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  39.43 
 
 		 615 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  39.51 
 
 		 658 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.9 
 
 		 614 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 626 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 		 622 aa  399  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 659 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  37 
 
 		 638 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  38.4 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 638 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  37.64 
 
 		 617 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 621 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 		 622 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 617 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  37.99 
 
 		 631 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 		 635 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 627 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 641 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 622 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.83 
 
 		 622 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  38.07 
 
 		 626 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 627 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  38.06 
 
 		 629 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.93 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.76 
 
 		 622 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 631 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  38.18 
 
 		 625 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 622 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  36.35 
 
 		 605 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 637 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 		 638 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  38.01 
 
 		 637 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 		 643 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2713  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 		 608 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2646  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 599 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.83 
 
 		 650 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.83 
 
 		 650 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  35.51 
 
 		 601 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 597 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.83 
 
 		 650 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.83 
 
 		 936 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  36.69 
 
 		 641 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  36.92 
 
 		 633 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2788  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 640 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0852598  normal  0.110267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>