More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2624 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 547 aa  1119    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  52.91 
 
 		 579 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  46.9 
 
 		 553 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  44.4 
 
 		 565 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  44.16 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  34.71 
 
 		 627 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.3 
 
 		 551 aa  293  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 		 559 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  32.63 
 
 		 567 aa  283  8.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  33.75 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 531 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  32.81 
 
 		 562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 597 aa  263  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 551 aa  249  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 568 aa  246  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 540 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.45 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 565 aa  238  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  32.31 
 
 		 567 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 		 548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 		 560 aa  224  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  29.71 
 
 		 545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 548 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.98 
 
 		 563 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  31.6 
 
 		 576 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.1 
 
 		 564 aa  213  7.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 554 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.56 
 
 		 572 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 559 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.72 
 
 		 563 aa  200  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 557 aa  200  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 557 aa  200  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 569 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  28 
 
 		 560 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  28.83 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 568 aa  190  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.35 
 
 		 556 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.02 
 
 		 609 aa  187  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 636 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 609 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 604 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 604 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 608 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 587 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 579 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 580 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 572 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 576 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 645 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  24.81 
 
 		 577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 512 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 596 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 505 aa  125  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 510 aa  123  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  27.72 
 
 		 605 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.56 
 
 		 510 aa  120  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.6 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  26.46 
 
 		 631 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 		 541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 		 523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 587 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 594 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.29 
 
 		 562 aa  113  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.95 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.69 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.75 
 
 		 587 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.93 
 
 		 543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  25.79 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  30.84 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 559 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 535 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 629 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.21 
 
 		 542 aa  110  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 515 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  23.74 
 
 		 722 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 600 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.88 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>