More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3512 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 580 aa  1193    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  57.59 
 
 		 572 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  51.59 
 
 		 587 aa  568  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  44.82 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  44.61 
 
 		 557 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  44.8 
 
 		 557 aa  477  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 		 560 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  43.34 
 
 		 636 aa  422  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  52.82 
 
 		 366 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 576 aa  240  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 604 aa  227  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 604 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.4 
 
 		 609 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 627 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 		 567 aa  184  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.14 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 597 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 551 aa  170  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.62 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 557 aa  156  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 562 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.7 
 
 		 564 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 557 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 565 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 547 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.22 
 
 		 563 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 		 553 aa  147  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.31 
 
 		 556 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.92 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 608 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 568 aa  144  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 554 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 565 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  24.67 
 
 		 560 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  24.67 
 
 		 560 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 569 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.61 
 
 		 565 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.68 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.8 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.22 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.99 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.99 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.99 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 510 aa  115  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.83 
 
 		 572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.45 
 
 		 562 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.09 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 659 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 559 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 512 aa  108  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.09 
 
 		 538 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 611 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 565 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 522 aa  104  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 		 576 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  26.3 
 
 		 535 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 625 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 535 aa  100  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.2 
 
 		 543 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 549 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 543 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 563 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.34 
 
 		 535 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.69 
 
 		 535 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 620 aa  97.8  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 		 519 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  21.71 
 
 		 645 aa  97.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  27.09 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  27.09 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.09 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.09 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  27.09 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  27.09 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.09 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.16 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 		 535 aa  96.3  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>