More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0482 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 531 aa  1081    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  37.33 
 
 		 627 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.25 
 
 		 551 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  35.28 
 
 		 567 aa  316  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 		 551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  33.13 
 
 		 567 aa  302  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  32.31 
 
 		 548 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  32.63 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  34.84 
 
 		 562 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 559 aa  286  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  32.72 
 
 		 545 aa  282  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 		 547 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 		 565 aa  279  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  33.77 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.94 
 
 		 552 aa  273  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  32.82 
 
 		 560 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  32.57 
 
 		 560 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 		 557 aa  263  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  33.84 
 
 		 569 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.92 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  32.94 
 
 		 576 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 		 579 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 		 568 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.14 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 		 560 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 559 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 		 587 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 563 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 565 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 576 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  30.44 
 
 		 572 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.38 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.11 
 
 		 563 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 560 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 636 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 		 580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 604 aa  161  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 604 aa  160  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  27.2 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 579 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.94 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.92 
 
 		 588 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 568 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 554 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.9 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 591 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.02 
 
 		 542 aa  124  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.85 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.39 
 
 		 546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 537 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 531 aa  120  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 528 aa  120  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 524 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.96 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 556 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.53 
 
 		 511 aa  118  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 607 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 607 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.34 
 
 		 531 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  23.05 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.02 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.01 
 
 		 589 aa  114  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 616 aa  114  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  24.63 
 
 		 549 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 525 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 525 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 537 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  24.14 
 
 		 541 aa  113  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 549 aa  113  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.67 
 
 		 527 aa  113  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 559 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.26 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 604 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.34 
 
 		 572 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 595 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>