More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2377 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
552 aa  1134    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  41.62 
 
 
594 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
510 aa  165  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.23 
 
 
562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
524 aa  162  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
512 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
600 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.94 
 
 
588 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.75 
 
 
546 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.05 
 
 
508 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 
554 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  31.87 
 
 
516 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
492 aa  145  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.69 
 
 
543 aa  144  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
543 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 
596 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.76 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 
540 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.77 
 
 
539 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 
534 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
557 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 
534 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.82 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.82 
 
 
479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25 
 
 
538 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.59 
 
 
560 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
501 aa  136  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 
509 aa  137  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.55 
 
 
542 aa  136  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  28.69 
 
 
538 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.71 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.71 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.86 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.71 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.54 
 
 
511 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.05 
 
 
524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.87 
 
 
544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.69 
 
 
532 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.34 
 
 
516 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.2 
 
 
531 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
597 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
548 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.29 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.57 
 
 
531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
569 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
508 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
509 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
559 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.75 
 
 
511 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
538 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
501 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
493 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26 
 
 
524 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
544 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  26.42 
 
 
587 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.51 
 
 
515 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.49 
 
 
535 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 
565 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
539 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
533 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.57 
 
 
605 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 
1437 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  22.86 
 
 
517 aa  124  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 
629 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
501 aa  124  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 
534 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.51 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.02 
 
 
540 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  25.85 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.48 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 
528 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.24 
 
 
511 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 
499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
522 aa  120  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.04 
 
 
563 aa  120  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 
529 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.88 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.8 
 
 
589 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.19 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.59 
 
 
537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.55 
 
 
505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>