More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0794 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
1437 aa  2927    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
607 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 
606 aa  177  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
544 aa  155  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.75 
 
 
546 aa  151  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
509 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.69 
 
 
524 aa  147  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
557 aa  146  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
533 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
619 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.67 
 
 
511 aa  139  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
544 aa  137  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
534 aa  137  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
596 aa  136  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 
558 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  26 
 
 
518 aa  134  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 
536 aa  133  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 
533 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
529 aa  132  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.07 
 
 
542 aa  132  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
532 aa  131  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
629 aa  131  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.23 
 
 
538 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
539 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
536 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.81 
 
 
540 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
533 aa  129  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
534 aa  128  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
544 aa  128  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.71 
 
 
524 aa  128  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 
539 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.49 
 
 
520 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
531 aa  127  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
530 aa  127  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 
505 aa  127  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
538 aa  126  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
552 aa  125  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.83 
 
 
542 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.39 
 
 
537 aa  125  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
540 aa  125  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 
529 aa  125  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
528 aa  125  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
618 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
566 aa  124  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
622 aa  124  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
530 aa  124  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.21 
 
 
534 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.75 
 
 
575 aa  123  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
595 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
508 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.09 
 
 
589 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.75 
 
 
575 aa  122  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.62 
 
 
511 aa  121  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.55 
 
 
575 aa  121  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.05 
 
 
575 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 
567 aa  120  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
575 aa  121  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.8 
 
 
532 aa  121  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 
607 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
575 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 
575 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
515 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.95 
 
 
511 aa  119  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.25 
 
 
575 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.81 
 
 
560 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
556 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 
631 aa  119  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
539 aa  119  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
636 aa  119  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
555 aa  118  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 
529 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.85 
 
 
575 aa  118  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 
607 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  23.9 
 
 
549 aa  118  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.69 
 
 
534 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
535 aa  118  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
556 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.36 
 
 
541 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
537 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.25 
 
 
555 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 
594 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 
528 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.18 
 
 
605 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.66 
 
 
565 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 
600 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.15 
 
 
532 aa  116  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.39 
 
 
511 aa  116  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
578 aa  116  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.58 
 
 
510 aa  116  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
510 aa  116  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.64 
 
 
559 aa  116  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 
559 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 
516 aa  115  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.46 
 
 
562 aa  115  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 
576 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
578 aa  114  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.24 
 
 
532 aa  114  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
565 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.12 
 
 
587 aa  113  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
586 aa  113  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>