More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0162 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 620 aa  1271    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  47.17 
 
 		 630 aa  547  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  46.59 
 
 		 625 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 		 625 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  45.05 
 
 		 625 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  45.62 
 
 		 654 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  42.36 
 
 		 619 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 		 626 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  43.88 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 659 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  40.48 
 
 		 634 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  40.49 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  41.52 
 
 		 636 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  39.22 
 
 		 633 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.21 
 
 		 577 aa  194  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 579 aa  161  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 636 aa  144  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 		 645 aa  136  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 560 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 		 608 aa  124  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.13 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 576 aa  118  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  22.05 
 
 		 553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 557 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 597 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 627 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 604 aa  107  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 559 aa  105  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 580 aa  98.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.27 
 
 		 552 aa  98.2  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 563 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  21.37 
 
 		 579 aa  94.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.43 
 
 		 609 aa  92  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.07 
 
 		 565 aa  91.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 		 557 aa  91.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 547 aa  91.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 551 aa  90.9  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.65 
 
 		 564 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 		 609 aa  87.4  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.65 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  21.53 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  23.71 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  21.27 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.39 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.38 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  22.2 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  23.33 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  22.04 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  35.96 
 
 		 573 aa  77  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  21.79 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  21.08 
 
 		 569 aa  74.3  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.23 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  21.94 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  30.2 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  22.65 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 548 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.55 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  28.57 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 		 588 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.46 
 
 		 607 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 		 629 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 576 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.1 
 
 		 626 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  20.67 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  21.9 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  23.22 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.32 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>