More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0082 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  77.09 
 
 		 633 aa  1020    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 636 aa  1301    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  48.7 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  47.58 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 		 625 aa  568  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  48.75 
 
 		 625 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  46.84 
 
 		 654 aa  552  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  42.81 
 
 		 659 aa  495  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  44.12 
 
 		 611 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  42.2 
 
 		 619 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  41.4 
 
 		 620 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  38.97 
 
 		 634 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  38.23 
 
 		 633 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  37.98 
 
 		 634 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 626 aa  303  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  24.2 
 
 		 577 aa  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 560 aa  111  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 636 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 		 645 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 		 608 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 559 aa  97.4  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 557 aa  95.5  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  29.24 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 597 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 547 aa  87.4  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  22.81 
 
 		 580 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.84 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 576 aa  80.5  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 604 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  28.83 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.53 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.19 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 536 aa  67.8  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  20.65 
 
 		 627 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  32.87 
 
 		 560 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  32.87 
 
 		 560 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.84 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 549 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  20.47 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  21.88 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 636 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  22.9 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  21.59 
 
 		 579 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.32 
 
 		 546 aa  62  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.54 
 
 		 552 aa  62  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.94 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 581 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  22.46 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 531 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.99 
 
 		 529 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 		 567 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  32.37 
 
 		 557 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.3 
 
 		 605 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  22.41 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  22.09 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  36.67 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  23.08 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  22.73 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 579 aa  57  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.01 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 588 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  30.77 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.81 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  21.18 
 
 		 609 aa  57  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.13 
 
 		 524 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 		 516 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.89 
 
 		 525 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 573 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.64 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 544 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 578 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 579 aa  55.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 510 aa  55.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>