More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0273 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  60.88 
 
 		 654 aa  832    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  59.87 
 
 		 625 aa  773    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 630 aa  1299    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  50.66 
 
 		 659 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  70.54 
 
 		 625 aa  922    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  54.8 
 
 		 611 aa  683    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  59.72 
 
 		 625 aa  774    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  47.77 
 
 		 619 aa  622  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  48.33 
 
 		 636 aa  582  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  47.65 
 
 		 633 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  47.88 
 
 		 620 aa  545  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  42.38 
 
 		 634 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  41.76 
 
 		 634 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  39.75 
 
 		 633 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 		 626 aa  369  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 579 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  28.22 
 
 		 577 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 		 608 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.52 
 
 		 572 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 604 aa  106  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 604 aa  104  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 609 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 553 aa  97.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  21.96 
 
 		 579 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 576 aa  92.8  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 597 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 580 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  22.53 
 
 		 548 aa  87.4  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 		 548 aa  87  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.11 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  23.46 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.03 
 
 		 627 aa  84  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  22.4 
 
 		 569 aa  83.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.76 
 
 		 556 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  21.94 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  21.37 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.92 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 636 aa  77.4  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  21.92 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.81 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.41 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 512 aa  76.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  21.24 
 
 		 554 aa  76.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  22.03 
 
 		 631 aa  74.7  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  28.92 
 
 		 560 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  28.43 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 544 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.33 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.56 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 		 581 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  22.33 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  22.44 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.42 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08370  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.12 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  23.53 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  24.94 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  22.3 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 526 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  35.88 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.3 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  24 
 
 		 631 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 631 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 588 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.81 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.72 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.89 
 
 		 532 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  27.51 
 
 		 381 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003025  ABC-type dipeptide transport system component  28.52 
 
 		 612 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.08 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.54 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>