More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0238 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  61.4 
 
 
625 aa  808    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
654 aa  1356    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  54.04 
 
 
611 aa  657    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  61.97 
 
 
630 aa  824    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  57.14 
 
 
625 aa  746    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  56.98 
 
 
625 aa  744    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  49.28 
 
 
619 aa  634  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  48.78 
 
 
659 aa  631  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  48.28 
 
 
633 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  47.35 
 
 
636 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  46.12 
 
 
620 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  41.15 
 
 
634 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  40.42 
 
 
634 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  39.9 
 
 
633 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  36.46 
 
 
626 aa  363  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  27.24 
 
 
577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
645 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 
608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
576 aa  109  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
636 aa  106  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.69 
 
 
572 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.55 
 
 
551 aa  98.2  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
559 aa  97.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
604 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.52 
 
 
557 aa  92.8  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
560 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
604 aa  91.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 
531 aa  89.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 
567 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 
597 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 
561 aa  85.5  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 
557 aa  85.1  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  22.11 
 
 
547 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  21.47 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 
631 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 
579 aa  77.4  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.86 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
529 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.42 
 
 
529 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.65 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.79 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.65 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 
559 aa  73.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 
528 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.03 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  22.35 
 
 
553 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  22.72 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 
610 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.22 
 
 
587 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08370  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.07 
 
 
547 aa  70.5  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.84 
 
 
545 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  20.8 
 
 
563 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.44 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 
631 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 
587 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  30.25 
 
 
560 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
516 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
551 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
540 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
631 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  29.63 
 
 
560 aa  65.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
527 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  25.69 
 
 
605 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 
636 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.72 
 
 
589 aa  64.7  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 
554 aa  64.3  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
580 aa  64.3  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  21.82 
 
 
565 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  25.67 
 
 
631 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 
589 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  34.06 
 
 
528 aa  63.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  33.1 
 
 
518 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.84 
 
 
527 aa  62  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 
499 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 
607 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 
600 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 
607 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
568 aa  61.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
580 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  24.66 
 
 
602 aa  61.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
580 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
602 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  22.04 
 
 
569 aa  60.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  24.66 
 
 
602 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  22.35 
 
 
527 aa  60.8  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2854  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.1 
 
 
540 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
588 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 
259 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.9 
 
 
564 aa  59.7  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  25.28 
 
 
587 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2145  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
537 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 
539 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>