More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0485 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
619 aa  1282    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  49.28 
 
 
654 aa  634  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  48.6 
 
 
630 aa  617  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  49.75 
 
 
625 aa  605  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 
625 aa  597  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  49.04 
 
 
625 aa  596  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 
611 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  43.14 
 
 
659 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  44.34 
 
 
633 aa  500  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  42.39 
 
 
636 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  42.6 
 
 
620 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  38.24 
 
 
634 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  37.89 
 
 
634 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  36.1 
 
 
633 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
626 aa  340  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.57 
 
 
577 aa  193  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
579 aa  171  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
645 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 
608 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
636 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
604 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
604 aa  110  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
597 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 
557 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
557 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.87 
 
 
572 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
559 aa  95.9  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 
627 aa  94.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 
576 aa  92.8  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
552 aa  90.9  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.12 
 
 
552 aa  90.9  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  22.66 
 
 
609 aa  87.8  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.47 
 
 
551 aa  86.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
580 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 
587 aa  83.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.6 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
559 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.08 
 
 
542 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
607 aa  78.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.64 
 
 
537 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 
547 aa  77.4  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
527 aa  77.4  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  33.74 
 
 
518 aa  77.4  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.85 
 
 
562 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 
565 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 
551 aa  77  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 
631 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.6 
 
 
587 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  32.17 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  25.07 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  35.25 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  32.76 
 
 
589 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 
544 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
544 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.69 
 
 
556 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 
550 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  21.59 
 
 
579 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  24.36 
 
 
523 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  34.84 
 
 
567 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.53 
 
 
529 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.45 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  23.31 
 
 
523 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  24.08 
 
 
523 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.62 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  22.55 
 
 
562 aa  70.5  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
559 aa  70.5  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.13 
 
 
528 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 
633 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.26 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 
589 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.81 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.81 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  29.74 
 
 
569 aa  67.8  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
565 aa  67.8  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.3 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
551 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 
588 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 
565 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
536 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
534 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0331  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
542 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.25 
 
 
568 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2856  putative oligopeptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  22.77 
 
 
603 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
529 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.35 
 
 
532 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.36 
 
 
515 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.16 
 
 
609 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.96 
 
 
520 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.03 
 
 
515 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1437  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 
603 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0112279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1699  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 
611 aa  64.3  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>