More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0564 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  71.84 
 
 		 606 aa  905    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 607 aa  1233    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  30.4 
 
 		 1437 aa  203  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.91 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.04 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.4 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 579 aa  110  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 578 aa  108  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  22.78 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 538 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 578 aa  101  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 528 aa  101  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  22.65 
 
 		 533 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  21.43 
 
 		 540 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 541 aa  96.3  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 		 619 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 		 600 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 532 aa  94.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 591 aa  93.6  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  20.77 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 618 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 		 541 aa  93.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.17 
 
 		 542 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.66 
 
 		 532 aa  92  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.14 
 
 		 520 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 576 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 529 aa  90.9  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 532 aa  90.1  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.53 
 
 		 535 aa  89  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.7 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.7 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  25.53 
 
 		 535 aa  89  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  25.53 
 
 		 535 aa  89  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.7 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.7 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.7 
 
 		 526 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  24.15 
 
 		 537 aa  87.4  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 529 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 516 aa  87.4  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 509 aa  87  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 535 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 531 aa  86.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.88 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  21.88 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 559 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.48 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 584 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.95 
 
 		 527 aa  83.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 595 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  21.58 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 541 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 583 aa  82  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  20.45 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.66 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.95 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  23.67 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.48 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.36 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 622 aa  80.9  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4336  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168516  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 535 aa  80.5  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  21.48 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  23.3 
 
 		 537 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  24.7 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.7 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.7 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 567 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>