More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1699 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  51.65 
 
 		 615 aa  656    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 		 592 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1699  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 611 aa  1264    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  50.97 
 
 		 616 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  49.34 
 
 		 600 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  48.93 
 
 		 606 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  48.27 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  45.41 
 
 		 615 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  45.41 
 
 		 623 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2050  extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 		 620 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  42.55 
 
 		 601 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  44.21 
 
 		 626 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  44.12 
 
 		 620 aa  511  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2625  extracellular solute-binding protein  45.56 
 
 		 610 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15211  decreased coverage  0.0000486729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  42.38 
 
 		 640 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  43.42 
 
 		 606 aa  492  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  43.17 
 
 		 610 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2613  extracellular solute-binding protein  42.81 
 
 		 604 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674629  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  44.25 
 
 		 621 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0931  extracellular solute-binding protein  42.53 
 
 		 618 aa  452  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 		 600 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1545  putative extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 606 aa  438  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.0971522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 		 615 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1506  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 604 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0138783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2856  putative oligopeptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  40.53 
 
 		 603 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1437  extracellular solute-binding protein  40.46 
 
 		 603 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0112279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 		 633 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.48 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 		 622 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  37.69 
 
 		 603 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 646 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  36.01 
 
 		 611 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  36.86 
 
 		 609 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  35.84 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.85 
 
 		 622 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 609 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 613 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 		 590 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2310  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0736306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  37.44 
 
 		 615 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.72 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 611 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  37.09 
 
 		 615 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 670 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  37.23 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  35.3 
 
 		 618 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 		 621 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  36.26 
 
 		 609 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.64 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  36.01 
 
 		 616 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  37.98 
 
 		 597 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.59 
 
 		 628 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  35.61 
 
 		 626 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  34.94 
 
 		 602 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 		 641 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  36.66 
 
 		 617 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  35.7 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  35.37 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.33 
 
 		 614 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 659 aa  364  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1343  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 609 aa  364  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 619 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 635 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 631 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 		 605 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 		 627 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  35.28 
 
 		 631 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 		 638 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 627 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 		 622 aa  357  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 		 638 aa  355  8.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  36.87 
 
 		 627 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  34.63 
 
 		 631 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 624 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 624 aa  350  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  35.08 
 
 		 631 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 		 626 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  35.36 
 
 		 637 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 624 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.27 
 
 		 650 aa  347  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.27 
 
 		 650 aa  347  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.27 
 
 		 650 aa  347  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.95 
 
 		 623 aa  347  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  34.79 
 
 		 630 aa  347  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  35.36 
 
 		 637 aa  346  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.14 
 
 		 936 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.06 
 
 		 650 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.12 
 
 		 686 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  34.99 
 
 		 658 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  34.3 
 
 		 625 aa  342  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 636 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 624 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.89 
 
 		 650 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>