More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0876 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  60.26 
 
 		 630 aa  766    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 625 aa  1282    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  53.4 
 
 		 659 aa  673    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  60.59 
 
 		 625 aa  764    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  57.14 
 
 		 654 aa  746    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  98.4 
 
 		 625 aa  1264    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  50.63 
 
 		 633 aa  619  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  53.41 
 
 		 611 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 619 aa  597  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  47.34 
 
 		 636 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  45.37 
 
 		 620 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  40.06 
 
 		 634 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  39.58 
 
 		 634 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  38 
 
 		 633 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 		 626 aa  362  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 579 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  25.27 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  26.66 
 
 		 645 aa  156  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 		 608 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 636 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 560 aa  123  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  26.79 
 
 		 572 aa  114  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 552 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 604 aa  104  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 609 aa  103  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 604 aa  99.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 531 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 567 aa  97.1  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 597 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 540 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 557 aa  95.5  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 557 aa  95.5  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 580 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 		 561 aa  95.1  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 579 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.31 
 
 		 556 aa  93.2  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.94 
 
 		 588 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 627 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 551 aa  93.2  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.87 
 
 		 551 aa  93.6  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 576 aa  91.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 		 588 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.33 
 
 		 562 aa  90.5  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 		 548 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 559 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 510 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 512 aa  88.6  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  22.43 
 
 		 548 aa  87.4  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.77 
 
 		 557 aa  87  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  33.9 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  35.98 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 589 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.35 
 
 		 609 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  31.7 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  31.7 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.79 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.28 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 631 aa  80.5  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  37.06 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2945  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 		 565 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472455  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  37.06 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.16 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  21.35 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.74 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 		 568 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08370  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.98 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  22.8 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  36.3 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  32.77 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.8 
 
 		 626 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 		 550 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>