More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6804 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  58.22 
 
 		 633 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 634 aa  1291    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  93.53 
 
 		 634 aa  1200    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  42.63 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  41.15 
 
 		 654 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 625 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 625 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  41.02 
 
 		 620 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  40.46 
 
 		 625 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 		 611 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  39.16 
 
 		 659 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  38.77 
 
 		 636 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 633 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 		 626 aa  359  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.54 
 
 		 577 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 608 aa  153  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 645 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 562 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 636 aa  114  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 560 aa  108  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 609 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 561 aa  105  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 559 aa  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.57 
 
 		 627 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 531 aa  102  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.73 
 
 		 572 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 576 aa  99.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.41 
 
 		 552 aa  98.2  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.84 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  25.14 
 
 		 560 aa  97.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  24.78 
 
 		 560 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 604 aa  95.9  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 604 aa  95.1  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 		 553 aa  90.5  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 		 579 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 597 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.47 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 565 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 557 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 557 aa  87.4  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 560 aa  87.8  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 		 567 aa  87  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.24 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 544 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.39 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  22.1 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.22 
 
 		 545 aa  80.1  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  22.53 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.51 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  21.5 
 
 		 540 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.2 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  22.81 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  23.79 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 549 aa  73.9  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 557 aa  70.5  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.52 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 576 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.78 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.32 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.33 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.33 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  25.53 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  25.53 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.09 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  22.85 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.33 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  21.5 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  22.75 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  22.61 
 
 		 615 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27 
 
 		 512 aa  67  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  24.91 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  34.13 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  24.91 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  24.91 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  22.83 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>