More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0531 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 626 aa  1290    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  40.94 
 
 		 620 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  36.81 
 
 		 659 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  36.03 
 
 		 630 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  35.87 
 
 		 625 aa  365  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  36.46 
 
 		 654 aa  363  5.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 		 625 aa  362  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  35.17 
 
 		 634 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  36.36 
 
 		 625 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  35.03 
 
 		 634 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 619 aa  340  7e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 633 aa  339  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 611 aa  325  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  33.93 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 633 aa  290  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  27.92 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 579 aa  177  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 636 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 560 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.66 
 
 		 627 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 597 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  23.13 
 
 		 572 aa  97.4  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 557 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 559 aa  95.5  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 604 aa  92.8  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 604 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 576 aa  88.6  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 629 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 557 aa  88.6  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 		 565 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 559 aa  87.8  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.57 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  22.05 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.15 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 569 aa  80.1  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  22.03 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 		 579 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.75 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  20.9 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  23.02 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.89 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.51 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 540 aa  70.1  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 536 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  20.95 
 
 		 608 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.45 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 600 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 552 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  27.76 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  29.14 
 
 		 518 aa  67.4  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 617 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.2 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  28.96 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 		 576 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.5 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  35.17 
 
 		 581 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.55 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.44 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.44 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.54 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.37 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.37 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  34.82 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.49 
 
 		 529 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.37 
 
 		 528 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 		 589 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>