More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1060 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  90.63 
 
 		 523 aa  956    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1041    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  90.06 
 
 		 523 aa  950    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  76.29 
 
 		 523 aa  821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  53.19 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  55.04 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  55.56 
 
 		 525 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  46.48 
 
 		 535 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  49.49 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  45.97 
 
 		 516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  33.47 
 
 		 533 aa  296  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 551 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 539 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  31.8 
 
 		 551 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 		 551 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 543 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.38 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.04 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  23.17 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 526 aa  113  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.85 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  22.5 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 532 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.82 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 528 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7516  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.04 
 
 		 565 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 536 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 535 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 525 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 538 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.64 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 531 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 513 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 521 aa  100  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  21.54 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  22.43 
 
 		 565 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.29 
 
 		 531 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 525 aa  97.8  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 531 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 518 aa  97.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  23.61 
 
 		 512 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  25.91 
 
 		 520 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  23.61 
 
 		 512 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  23.61 
 
 		 512 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  23.61 
 
 		 512 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  23.61 
 
 		 512 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.54 
 
 		 520 aa  96.7  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  26.68 
 
 		 544 aa  96.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 529 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 542 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  22.99 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 516 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  25.45 
 
 		 524 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.14 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  25.45 
 
 		 524 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.43 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 520 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  24.08 
 
 		 533 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  22.2 
 
 		 541 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.98 
 
 		 512 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.45 
 
 		 524 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.45 
 
 		 524 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  22.62 
 
 		 520 aa  94.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>