More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08861 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  65.31 
 
 		 516 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  67.62 
 
 		 535 aa  682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 491 aa  995    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  61.35 
 
 		 534 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  55.74 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  55.94 
 
 		 525 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  49.49 
 
 		 523 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  49.69 
 
 		 523 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  49.69 
 
 		 523 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  49.49 
 
 		 523 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  37.68 
 
 		 533 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  35.03 
 
 		 541 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 551 aa  269  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 539 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 543 aa  242  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 534 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.47 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.58 
 
 		 532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 512 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  27.3 
 
 		 536 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.12 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.12 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.12 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 501 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.56 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 501 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.56 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.95 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.95 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.19 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.12 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.56 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.95 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.95 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.95 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.15 
 
 		 526 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 525 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.06 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.9 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.82 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  29 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 544 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26 
 
 		 520 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.7 
 
 		 556 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.3 
 
 		 516 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 518 aa  103  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 519 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 523 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25.61 
 
 		 520 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  25.84 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.48 
 
 		 517 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.91 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 535 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 500 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.06 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.47 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.06 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.06 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.11 
 
 		 525 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.06 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.87 
 
 		 516 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.51 
 
 		 505 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.06 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.06 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  26.06 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 		 503 aa  97.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 607 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.9 
 
 		 532 aa  96.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.66 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>