More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3994 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
541 aa  1096    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  52.9 
 
 
539 aa  596  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  53.56 
 
 
551 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  50.47 
 
 
543 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  49.72 
 
 
551 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  49.53 
 
 
551 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  54.34 
 
 
533 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  34.68 
 
 
491 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  32.44 
 
 
535 aa  279  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  31.47 
 
 
523 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  31.95 
 
 
523 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  31.54 
 
 
523 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  31.4 
 
 
523 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  32.53 
 
 
516 aa  266  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  30.65 
 
 
534 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
501 aa  260  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 
501 aa  259  9e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  31.2 
 
 
525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 
501 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  31.81 
 
 
525 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 
499 aa  237  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
529 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 
528 aa  221  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 
525 aa  218  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
526 aa  213  9e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
545 aa  211  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  27.02 
 
 
544 aa  163  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
515 aa  163  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 
534 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.14 
 
 
535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.53 
 
 
541 aa  146  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 
543 aa  143  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.33 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.71 
 
 
510 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
528 aa  136  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.37 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.73 
 
 
565 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
544 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
544 aa  134  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.2 
 
 
520 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.37 
 
 
509 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  25.19 
 
 
523 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 
589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.87 
 
 
551 aa  130  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  26.27 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  25.91 
 
 
533 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
540 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 
521 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.42 
 
 
521 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
521 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 
521 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
542 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.76 
 
 
540 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
522 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.23 
 
 
521 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
530 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25.95 
 
 
540 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.33 
 
 
535 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
510 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 
536 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  25.71 
 
 
533 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
538 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.33 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.33 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.33 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.33 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.33 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.33 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
531 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.33 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
501 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
548 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
523 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
550 aa  120  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.79 
 
 
532 aa  120  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  23.99 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  25.43 
 
 
537 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  24.36 
 
 
541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.26 
 
 
532 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.95 
 
 
526 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  25.89 
 
 
537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
551 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
550 aa  117  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.31 
 
 
542 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26 
 
 
512 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  26.25 
 
 
532 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.39 
 
 
525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>