More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0821 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  100 
 
 		 533 aa  1066    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  49.62 
 
 		 551 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  52.52 
 
 		 541 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  46.53 
 
 		 543 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  49 
 
 		 539 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  46.59 
 
 		 551 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  46.59 
 
 		 551 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  37.67 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  33.78 
 
 		 523 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  36.47 
 
 		 516 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  34.66 
 
 		 534 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  37.68 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  32.89 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  36.4 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  33.4 
 
 		 523 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  33.4 
 
 		 523 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  35.97 
 
 		 525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 		 501 aa  282  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 499 aa  257  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 545 aa  233  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 		 525 aa  230  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 526 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.89 
 
 		 523 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.02 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.02 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.02 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.02 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.02 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.02 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.02 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.45 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.58 
 
 		 535 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.79 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 582 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 543 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.19 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.99 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.99 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.19 
 
 		 512 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.99 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.8 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 528 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.84 
 
 		 505 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.3 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  25.9 
 
 		 544 aa  154  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.9 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.42 
 
 		 521 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.42 
 
 		 521 aa  153  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.42 
 
 		 521 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 521 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.76 
 
 		 541 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.33 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 548 aa  150  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.01 
 
 		 524 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.26 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.37 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.26 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.46 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.87 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.26 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.26 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.76 
 
 		 493 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  30.91 
 
 		 562 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.97 
 
 		 516 aa  146  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 512 aa  146  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 517 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.05 
 
 		 517 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.49 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.86 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 520 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 523 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 542 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.67 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  25.67 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 		 544 aa  140  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>