More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11431 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
534 aa  1085    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  61.35 
 
 
491 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  56.05 
 
 
525 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  54.44 
 
 
535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  51.77 
 
 
516 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  57.06 
 
 
525 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  53.19 
 
 
523 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  52.11 
 
 
523 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  51.92 
 
 
523 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  51.37 
 
 
523 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  35.32 
 
 
533 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 
551 aa  264  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  30.81 
 
 
541 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
539 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  32.72 
 
 
551 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  32.72 
 
 
551 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
543 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
501 aa  144  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
501 aa  143  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 
534 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
499 aa  136  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.65 
 
 
512 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.65 
 
 
512 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.65 
 
 
512 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.65 
 
 
512 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.19 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.1 
 
 
512 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.87 
 
 
512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.87 
 
 
512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.87 
 
 
512 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.87 
 
 
512 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
512 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.1 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.91 
 
 
493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
526 aa  125  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.2 
 
 
526 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
519 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.8 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.24 
 
 
541 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
520 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 
528 aa  123  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.89 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.05 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
520 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 
532 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.43 
 
 
532 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
517 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
520 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 
562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
525 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 
518 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 
580 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
518 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
507 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.85 
 
 
517 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.33 
 
 
490 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.94 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  24.75 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  23.87 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.25 
 
 
507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
549 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 
536 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.64 
 
 
528 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
513 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 
513 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
510 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 
525 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.29 
 
 
510 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25 
 
 
520 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 
522 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
515 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 
535 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
516 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 
582 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 
550 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  24.66 
 
 
533 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
544 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.21 
 
 
554 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>