More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3102 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  65.63 
 
 
541 aa  761    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  67.37 
 
 
525 aa  749    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  78.46 
 
 
551 aa  903    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  67.23 
 
 
525 aa  753    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  66 
 
 
541 aa  766    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  63.99 
 
 
582 aa  702    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  65.37 
 
 
541 aa  748    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  65.19 
 
 
541 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  65.37 
 
 
541 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  62.29 
 
 
541 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  66.67 
 
 
542 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  65.19 
 
 
541 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  62.78 
 
 
542 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  69.23 
 
 
547 aa  790    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  67.23 
 
 
525 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
549 aa  1141    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  48.95 
 
 
556 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  46.02 
 
 
544 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02835  putative ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  45.82 
 
 
578 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.71 
 
 
535 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  41.53 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  41.53 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  42.83 
 
 
580 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.53 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.53 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  41.53 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  41.53 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.53 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  41.73 
 
 
562 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.57 
 
 
526 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  43.76 
 
 
531 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.38 
 
 
526 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  42.86 
 
 
535 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  41.24 
 
 
582 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.57 
 
 
526 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.57 
 
 
526 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  42.57 
 
 
526 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  42.57 
 
 
535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  43.17 
 
 
531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  41.31 
 
 
535 aa  445  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  41.89 
 
 
535 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  42.49 
 
 
538 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  41.31 
 
 
535 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  42.77 
 
 
531 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  39.96 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  40.64 
 
 
581 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.49 
 
 
547 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 
547 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.58 
 
 
535 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2540  peptide transport periplasmic protein precursor  41.72 
 
 
548 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 
533 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  42.6 
 
 
532 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  41.58 
 
 
535 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 
506 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  41.58 
 
 
535 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 
532 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 
535 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  39.96 
 
 
549 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  41.24 
 
 
531 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  41.6 
 
 
530 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  40.57 
 
 
531 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 
541 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.02 
 
 
530 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 
530 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  42.41 
 
 
532 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 
532 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  42.24 
 
 
530 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  41.05 
 
 
531 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1458  peptide transport periplasmic protein SapA  39.76 
 
 
549 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.23 
 
 
535 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 
535 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 
529 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  39.76 
 
 
549 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  40.59 
 
 
531 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1816  peptide transport periplasmic protein SapA  39.76 
 
 
549 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.440252  hitchhiker  0.00000000112139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  40.82 
 
 
530 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1878  peptide transport periplasmic protein SapA  39.96 
 
 
557 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  40.76 
 
 
533 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  40.43 
 
 
531 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01870  hypothetical protein  42.06 
 
 
539 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  39.69 
 
 
541 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  40.83 
 
 
532 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  43.91 
 
 
532 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
532 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  40.76 
 
 
533 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 
541 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 
542 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 
541 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3923  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 
528 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333304  normal  0.449349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  39.25 
 
 
537 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3416  extracellular solute-binding protein  42.32 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.680015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  39.64 
 
 
537 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.23 
 
 
530 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
530 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  39.72 
 
 
543 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01271  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  38.19 
 
 
547 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  39.69 
 
 
540 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  39.77 
 
 
542 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 
553 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>