More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5439 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5439  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
593 aa  1147    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.16 
 
 
540 aa  163  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.82 
 
 
538 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
540 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
534 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
533 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.94 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
551 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
565 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.35 
 
 
520 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 
576 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 
533 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
866 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.49 
 
 
534 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 
535 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.33 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
519 aa  130  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
530 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
530 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
530 aa  126  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 
622 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
563 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 
492 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.62 
 
 
524 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 
629 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
489 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 
534 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0331  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
542 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.79 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 
553 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
502 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 
508 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
536 aa  120  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.79 
 
 
511 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
490 aa  120  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.26 
 
 
543 aa  120  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.55 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
543 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 
631 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.18 
 
 
516 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.79 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  23.08 
 
 
526 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.03 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 
544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.92 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
544 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 
509 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.41 
 
 
542 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.02 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
532 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.88 
 
 
532 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
531 aa  113  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
564 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.36 
 
 
520 aa  113  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 
544 aa  113  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.31 
 
 
524 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.47 
 
 
526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.47 
 
 
526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  26.28 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.95 
 
 
542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.03 
 
 
532 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
636 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.9 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 
542 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.59 
 
 
589 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 
589 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.94 
 
 
525 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 
501 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
545 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 
555 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 
499 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 
527 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0216  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
569 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.2 
 
 
531 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>