64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1006 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 345 aa  718    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  67.2 
 
 		 316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  49.83 
 
 		 299 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  45.71 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  47.87 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  49.12 
 
 		 350 aa  299  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  50.67 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  46.29 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  49.66 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  44.63 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  42.76 
 
 		 306 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  45.92 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  44.41 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  43.04 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  42.72 
 
 		 313 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  44.67 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  41.16 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  45.7 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  42.72 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  43.89 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  43.52 
 
 		 311 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  41.03 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  36.81 
 
 		 515 aa  212  7.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  41.46 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  37.91 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  39.63 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  37.27 
 
 		 708 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  39.01 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  38.75 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  39.63 
 
 		 380 aa  196  3e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  36.59 
 
 		 786 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1699  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.7 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.19 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.41 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.49 
 
 		 244 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  26.58 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  29.59 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.6 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0647  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.5 
 
 		 229 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 258 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.71 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.57 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  23.88 
 
 		 680 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2272  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like protein  32.69 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.487332  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0634  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.24 
 
 		 227 aa  46.6  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000476119  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2732  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.52 
 
 		 231 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.107407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.4 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1692  putative ribonucleotide reductase activating transmembrane protein  24.7 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016777  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0104  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.28 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0085  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.84 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0514  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.01 
 
 		 227 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 351 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  29.52 
 
 		 491 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>