42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0272 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 303 aa  636    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  66.78 
 
 		 297 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  65.67 
 
 		 297 aa  394  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  57.93 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  56.07 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  48.59 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  45.92 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  47.62 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  42.18 
 
 		 330 aa  241  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  41.84 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  41.24 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  41.42 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  40.27 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  36.33 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  35.71 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  35.64 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  35.64 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  34.68 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  39.31 
 
 		 364 aa  195  8.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  34.78 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  36.95 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  36.75 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.09 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  37.75 
 
 		 351 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  36.36 
 
 		 358 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  37.42 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  36.51 
 
 		 358 aa  175  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  36.24 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  32.46 
 
 		 708 aa  162  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  35.59 
 
 		 515 aa  162  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  34.33 
 
 		 786 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2272  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like protein  30.81 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.487332  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  27.88 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  24.9 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  23.91 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  25.26 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.2 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>