34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0289 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 297 aa  622  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  65.67 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  64.41 
 
 		 297 aa  388  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  54.75 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  55.15 
 
 		 311 aa  331  9e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  45.7 
 
 		 345 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  44.33 
 
 		 316 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  45.64 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  43.45 
 
 		 345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  41.67 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  41.79 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  43.82 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  42.09 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  39.94 
 
 		 361 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  40.4 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  35.49 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  38.67 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  37.37 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  36.52 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  37.04 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  34.71 
 
 		 341 aa  188  9e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  32.09 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.75 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  39.2 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  39.2 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  37.54 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  35.33 
 
 		 358 aa  170  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  35.06 
 
 		 786 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  32.36 
 
 		 708 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  35.04 
 
 		 515 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  34.08 
 
 		 416 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  26.78 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>