40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0751 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 
313 aa  646    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  76.04 
 
 
313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  76.36 
 
 
313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  76.04 
 
 
313 aa  512  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  66.24 
 
 
319 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  44.41 
 
 
345 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  39.35 
 
 
330 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  42.43 
 
 
316 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  38.03 
 
 
350 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  37.7 
 
 
345 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  37.58 
 
 
325 aa  228  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  41.53 
 
 
308 aa  226  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  39.75 
 
 
341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  37.7 
 
 
299 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  37.92 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  37.94 
 
 
361 aa  216  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  35.31 
 
 
306 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  35.71 
 
 
303 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  36.42 
 
 
364 aa  205  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  36.22 
 
 
351 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  38.12 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  35.49 
 
 
297 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  35.91 
 
 
351 aa  194  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.15 
 
 
380 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  36.88 
 
 
358 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  34.54 
 
 
358 aa  183  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  36.16 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  33.96 
 
 
515 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  31.78 
 
 
708 aa  156  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  31.91 
 
 
786 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  32.53 
 
 
416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 
332 aa  45.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 
501 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.44 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  25.89 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 
344 aa  42.7  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>