48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2970 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 		 345 aa  720    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  84.86 
 
 		 350 aa  626  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  74.61 
 
 		 325 aa  523  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  73.1 
 
 		 330 aa  497  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  45.71 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  44.52 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  47.39 
 
 		 299 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  43.51 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  45.99 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  44.13 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  43.45 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  37.7 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  41.92 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  38.52 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  41.78 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  36.72 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  41.04 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  36.39 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  36.07 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  34.39 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  41.47 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  36.96 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.66 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  41.01 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  40.65 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  39.15 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  38.78 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  33.44 
 
 		 708 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  37.02 
 
 		 515 aa  189  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  33.33 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  34.41 
 
 		 786 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  23.11 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 300 aa  46.2  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1600  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.45 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.78 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.68 
 
 		 244 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>