34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1738 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 364 aa  761    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  75.21 
 
 		 361 aa  594  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  50 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  43.89 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  43 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  41.86 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  41.72 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  39.74 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  39.42 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  39.42 
 
 		 313 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  39.02 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  41.3 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  42.91 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  36.89 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  39.87 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  38.79 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  41.84 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  39.56 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  36.42 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  36.42 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  41.47 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.97 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  36.84 
 
 		 515 aa  199  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  40.52 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  40.07 
 
 		 297 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  37.93 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  36.48 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  33.94 
 
 		 708 aa  181  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  35.47 
 
 		 786 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  34.23 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  35.92 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.18 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  20.68 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>