47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0408 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  100 
 
 		 299 aa  620  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  49.83 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  46.71 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  47.39 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  46 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  46.53 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  45.48 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  48.11 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  45.24 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  44.48 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  47.62 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  42.19 
 
 		 361 aa  242  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  44.93 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  43 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  41.39 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  41.39 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  38.91 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  41.45 
 
 		 358 aa  225  9e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  41.06 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  36.25 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  37.7 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  41 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  42.99 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  44.29 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  41.98 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  41.67 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  40.5 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  37.36 
 
 		 515 aa  192  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  35.92 
 
 		 708 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  35.74 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  36.69 
 
 		 786 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 501 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.3 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  21.4 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  31.58 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  21.11 
 
 		 369 aa  46.2  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  21.02 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.62 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 440 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2272  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like protein  25 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.487332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 393 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>