197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1281 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  597  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  46.92 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  45.12 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  46.98 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  45.02 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  40.61 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  38.92 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  40.1 
 
 		 380 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  36.76 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  38.81 
 
 		 391 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  38.81 
 
 		 392 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 		 392 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 		 388 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  37.44 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  41.14 
 
 		 182 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  36.76 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  37.81 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  37.06 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  37.06 
 
 		 384 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  37.23 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  36.04 
 
 		 387 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 		 392 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  39.79 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 385 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 385 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 385 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  37.31 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  36.54 
 
 		 352 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  36.55 
 
 		 386 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  39.01 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  36.22 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  35.53 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  35.53 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  38.82 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  35.86 
 
 		 377 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  36.32 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  37.1 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  34.4 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 		 350 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  40.31 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 353 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  38.2 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 		 374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 		 395 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.2 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 		 387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  37.06 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  34.16 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  34.18 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  34.76 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 		 421 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  32.24 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  35.23 
 
 		 356 aa  108  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  34.13 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  33.19 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  33.51 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  29.57 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  30.57 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  33.17 
 
 		 381 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 362 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  35.11 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  30.65 
 
 		 360 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  37.04 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  38.22 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>