More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5689 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5689  Radical SAM domain protein  100 
 
 
416 aa  826    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1702  hypothetical protein  38.35 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0534868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5065  hypothetical protein  37.88 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613566  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1780  hypothetical protein  37.64 
 
 
292 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.475693 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6312  hypothetical protein  38.11 
 
 
292 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.668118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1767  hypothetical protein  38.11 
 
 
292 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1476  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1291  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 
310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  25.95 
 
 
649 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3341  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1436  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.01 
 
 
326 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  36.27 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.4 
 
 
326 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  30.34 
 
 
359 aa  57  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.04 
 
 
332 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  32.77 
 
 
292 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  37.93 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.71 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.71 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.48 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  40.23 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  36.44 
 
 
471 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 
320 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
1000 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0308  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25 
 
 
328 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.11 
 
 
326 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 
533 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
328 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  34.51 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.61 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
333 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
320 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.87 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.71 
 
 
317 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.31 
 
 
296 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.71 
 
 
335 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
320 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
298 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.17 
 
 
326 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.43 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  35.29 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1242  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.19 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00350809  normal  0.534968 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.08 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.86 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  32.23 
 
 
503 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  29.63 
 
 
384 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.57 
 
 
326 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.71 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.17 
 
 
333 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  31.25 
 
 
367 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.2 
 
 
336 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  32.5 
 
 
326 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 
468 aa  50.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.73 
 
 
298 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.73 
 
 
298 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  37.62 
 
 
402 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 
332 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 
326 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.34 
 
 
326 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3146  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  33.04 
 
 
326 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.3 
 
 
323 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 
367 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.81 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  31.53 
 
 
486 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 
265 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.25 
 
 
251 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  28.57 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.76 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.03 
 
 
323 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
1002 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3047  radical SAM family protein  28.21 
 
 
153 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.65 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.2 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3511  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000437292  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.77 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.02 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.97 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 
501 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.01 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0337  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  35.29 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.910296  hitchhiker  4.2899899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.48 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.92 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.93 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.77 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0893  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.2 
 
 
208 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.12 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.36 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.45 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>