171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2382 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2382  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  912    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0451  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  66.44 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.591016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0786  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 
539 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0837  Methyltransferase type 12  38.42 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
382 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  40.45 
 
 
304 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  39.58 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1077  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.03 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  39.58 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.89 
 
 
394 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.39 
 
 
446 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1831  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.32 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.83 
 
 
428 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.66 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.7 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.01 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1115  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.34 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.9654 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  36.27 
 
 
310 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 
572 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  37.5 
 
 
309 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
328 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.96 
 
 
420 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  36.46 
 
 
311 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.95 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  37.93 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.3 
 
 
330 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.8 
 
 
413 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  35.48 
 
 
214 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0127  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.97 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  31.37 
 
 
242 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0428  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.91 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  27.33 
 
 
342 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
276 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
284 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175202  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.25 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.3 
 
 
428 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1620  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1441  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.62 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.351858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
275 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0725  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.92 
 
 
427 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3368  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.42 
 
 
426 aa  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1341  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.78 
 
 
394 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.9 
 
 
408 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  29.7 
 
 
208 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  25.45 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  37.5 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  32.04 
 
 
217 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
282 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.89 
 
 
683 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  32.1 
 
 
202 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  34.83 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
261 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0803  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.63 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1484  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.87 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4014  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.95 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.922608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  31.75 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2100  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.72 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  29.45 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.71 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  37.5 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1385  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.25 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  29.41 
 
 
229 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.8 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3871  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.27 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  24.49 
 
 
277 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.56 
 
 
394 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  29.41 
 
 
229 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0818  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.8 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.04 
 
 
394 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  29.41 
 
 
229 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1075  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.25 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  23.2 
 
 
559 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0957  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.1 
 
 
378 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1283  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.1 
 
 
440 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204658  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
286 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3379  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.87 
 
 
418 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1241  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.68 
 
 
418 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101333  normal  0.895253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1171  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.68 
 
 
418 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.97 
 
 
345 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0640  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.03 
 
 
432 aa  47  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1170  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.68 
 
 
418 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513218  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13752  fatty acid synthase  26.53 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.496318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.14 
 
 
471 aa  46.6  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.9 
 
 
417 aa  46.6  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.178354 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07375  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2223  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  35.14 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  31.09 
 
 
229 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.05 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1990  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.6 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0956  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.47 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  30.11 
 
 
202 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
278 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01818  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.02 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>