260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2619 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2619  Methyltransferase type 11  100 
 
 
286 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188551  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4613  Methyltransferase type 11  67.5 
 
 
282 aa  398  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000005749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1990  Methyltransferase type 11  70.7 
 
 
280 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  29.71 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  27.18 
 
 
318 aa  79  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.63 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.36 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  23.93 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  24.78 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.62 
 
 
424 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.57 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 
284 aa  58.9  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  36.23 
 
 
387 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.83 
 
 
396 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0788  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.98 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  36.23 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  36.23 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.56 
 
 
413 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1620  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.53 
 
 
419 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
413 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  33.03 
 
 
392 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.71 
 
 
418 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  24.17 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.53 
 
 
683 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.32 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  35.51 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.44 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1441  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.71 
 
 
419 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.351858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  29.44 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.48 
 
 
494 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
274 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.22 
 
 
434 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4741  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 
423 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.63 
 
 
471 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  30 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.02 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  25 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2162  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.51 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.125639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.99 
 
 
445 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.13 
 
 
412 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0963  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.29 
 
 
418 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.5 
 
 
398 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.55 
 
 
420 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  37.33 
 
 
949 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.26 
 
 
408 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2992  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.94 
 
 
421 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.6 
 
 
417 aa  52.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003861  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.13 
 
 
418 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  22.16 
 
 
283 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
271 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.35 
 
 
415 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.82 
 
 
426 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0580  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.08 
 
 
426 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
1012 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0329  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  42.62 
 
 
376 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.88 
 
 
426 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.567073  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  32.81 
 
 
394 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.82 
 
 
426 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1487  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.43 
 
 
424 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0451  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.11 
 
 
427 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.921237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2291  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.31 
 
 
416 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.66 
 
 
403 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13752  fatty acid synthase  31.45 
 
 
420 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.496318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.37 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0988  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40 
 
 
417 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  32.81 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0585  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.1 
 
 
419 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  36.11 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.38 
 
 
419 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.38 
 
 
419 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  31.31 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.57 
 
 
447 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3810  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.17 
 
 
366 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.22407 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  29.37 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2709  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.84 
 
 
417 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0956  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.8 
 
 
422 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.753631  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  28.03 
 
 
387 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.94 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0540  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.48 
 
 
419 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109012  normal  0.39932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  34.72 
 
 
422 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5830  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.73 
 
 
405 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1917  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.53 
 
 
424 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0513783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0777  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.11 
 
 
442 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>