239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4613 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4613  Methyltransferase type 11  100 
 
 
282 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000005749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2619  Methyltransferase type 11  67.5 
 
 
286 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188551  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1990  Methyltransferase type 11  68.25 
 
 
280 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.77 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.38 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  26.32 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  26.84 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.94 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6098  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.68 
 
 
414 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0238295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.3 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.69 
 
 
428 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.47 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  35 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  36.08 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  26.98 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  25.43 
 
 
392 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  29.75 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  31.48 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  35.71 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.78 
 
 
413 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2417  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.05 
 
 
414 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.59 
 
 
396 aa  56.2  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 
413 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.29 
 
 
424 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.08 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.97 
 
 
683 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.29 
 
 
409 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  26.67 
 
 
377 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
1012 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.48 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  24.69 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.48 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.68 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00511048  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.48 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  27.98 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2992  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.19 
 
 
421 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.06 
 
 
658 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2396  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.53 
 
 
406 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.19 
 
 
330 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
276 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  34.86 
 
 
304 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.25 
 
 
457 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.51 
 
 
403 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  26.78 
 
 
423 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6581  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.67 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  35.35 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  29.52 
 
 
559 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 
434 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.19 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  27.16 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0741  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.97 
 
 
454 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1388  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.45 
 
 
407 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.420857  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.02 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2554  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.61 
 
 
409 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0910819  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.97 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.82 
 
 
421 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4070  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.84 
 
 
422 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802805  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1177  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.26 
 
 
453 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.97 
 
 
406 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  32.38 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 
420 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0513  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.7 
 
 
404 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145575  normal  0.33275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  27.71 
 
 
278 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0358  cyclopropane fatty acid synthase family protein  32.58 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000119082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1060  cyclopropane fatty acid synthase family protein  32.58 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0903  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.58 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00630694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0106  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.58 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000308019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0658  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.58 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0338601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  24.1 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2493  cyclopropane fatty acid synthase family protein  32.58 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000280606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  34 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>