206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2428 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2428  methyltransferase type 12  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  33.48 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2683  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.11 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.92 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.17 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  27.92 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.16 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2417  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.47 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.88 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  32.26 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.85 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 457 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 280 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  29.52 
 
 		 328 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  26.16 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.58 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.62 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1762  demethylmenaquinone methyltransferase  23.23 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.98 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.17 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.42 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  40.66 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3273  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.12 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  26.11 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  30.82 
 
 		 353 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1908  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.95 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04841  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  23.29 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.49 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  30.65 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  31.06 
 
 		 338 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0047  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.76 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.601084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  21.43 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.44 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2496  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.08 
 
 		 392 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.44 
 
 		 305 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.38 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.57 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 305 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  27.91 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  31.62 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.28 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.84 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  33.93 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  29.24 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.13 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  29.1 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  26.28 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  25.9 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1366  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.54 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0509799  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.49 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.83 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>